Abstract The goal of this study is to review the overall prevalence, burden, and distribution of the dengue disease in Pakistan from 2000 to 2019. Literature was searched using different search engines like Google scholar, PubMed, etc. providing the keywords “Dengue disease/infection, Dengue virus, DENV, DF/DHF/ DSS Pakistan”. All the published research papers/reports on the dengue virus over the period 2000 to 2019 were studied and selected data were summarized using MS Excel for windows such as total cases, age wise, gender, DENV serotype distribution, total DHF, and DSS patients. The literature providing insufficient data was excluded. The total number of cases reported during 2000-19 were 201,269. The maximum number of cases during the mentioned literature survey period was reported in Khyber Pakhtunkhwa (KP) (23.3%) followed by Punjab (3.8%) and Sindh (1.9%). The majority of dengue-infected cases were reported as Dengue fever (74.4%) followed by DHF (24.1%) and DSS (1.5%). Overall the deaths during the mentioned literature survey were 1082, of which the maximum mortalities were reported from KP (N=248) followed by Punjab (N=220). DENV remains a major public health problem in Pakistan and seems to remain endemic for a long time. The total prevalence of dengue infection is increased accordingly with time from 2000 to 2019. Moreover, all the four serotypes exist in Pakistan with increased mortalities.

Resumo A literatura foi examinada através de diferentes mecanismos de pesquisa, como Google Acadêmico, PubMed, etc., fornecendo as palavras-chave “Dengue disease/infection, Dengue virus, DENV, DF/DHF/ DSS Pakistan”. Todos os trabalhos/relatórios de pesquisa publicados sobre o vírus da dengue no período de 2000 a 2019 foram analisados e os dados selecionados foram coletados e resumidos usando o MS Excel para janelas como total de casos, idade, sexo, distribuição de sorotipos, total de DHF e pacientes com DSS. A literatura que forneceu dados insuficientes foi excluída. O número total de casos notificados de 2000 a 2019 foi de 201.269. O número máximo de casos durante o período de levantamento da literatura mencionado foi relatado em KP (23,3%), seguido por Punjab (3,8%) e Sindh (1,9%). A maioria dos casos de infecção por dengue foi relatada como Dengue (74,4%), seguida por FHD (24,1%) e DSS (1,5%). No geral, as mortes durante a pesquisa de literatura mencionada foram 1.082, das quais as morbidades máximas foram relatadas em KP (248), seguidas por Punjab, com um total de 220 mortes. O DENV continua sendo um grande problema de saúde pública no Paquistão e é considerado endêmico agora e provavelmente permanecerá por muito tempo. A prevalência total de infecção por dengue foi aumentada conforme a pesquisa de literatura publicada entre 2000 e 2019. A mortalidade por DENV também aumentou. Todos os 4 sorotipos, bem como em várias formas, existem no Paquistão.

Resumo O rotavírus é o principal agente infeccioso da gastroenterite aguda (AGE) em crianças menores de 5 anos e causa de morbidade e mortalidade significativas em todo o mundo. O estudo foi realizado para detectar a taxa de prevalência, cepa de genótipos e fatores de risco de rotavírus entre as crianças de áreas rurais e urbanas do distrito de Bannu Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão. Um total de 180 amostras de fezes foi coletada de crianças menores de 5 anos de dois grandes hospitais de Bannu de janeiro a dezembro (2015). As amostras foram analisadas por reação em cadeia da polimerase transcriptase reversa (RT-PCR) para detecção de rotavírus; as amostras positivas foram posteriormente processadas para genotipagem (tipo G e P) através de PCR específica. Do total, 41 (23%) amostras foram positivas para rotavírus. Os genótipos G mais prevalentes encontrados foram: G3, G8, G9 (cada 29%), seguidos de G10 (15%) e G11 (10%). Considerando que os genótipos P prevalentes foram: P-8 (25%), P-4 e P-10 (cada 20%), P-9 (15%), seguido por P-6 e P-11 (cada 10%). Além disso, a infecção por rotavírus foi mais prevalente no verão (23,73%) e inverno (22,7%) do que na primavera (20%) e no outono (21,4%). A infecção por rotavírus apresentou alta frequência em junho (14%), outubro (8%) e novembro (6%). Conclui-se que o rotavírus é mais prevalente em crianças e vários genótipos (G e P) do rotavírus estão presentes na área de estudo. A falta de estudos, conhecimento e testes mais raros de rotavírus são as principais razões da prevalência do vírus no distrito de Bannu, Paquistão.

Abstract Rotavirus is the main infective agent of acute gastroenteritis (AGE) in children under the age of five years and causing significant morbidity as well as mortality throughout the world. The study was carried out to detect the prevalence rate, genotypes strain and risk factors of Rotavirus among the children of rural and urban areas of district Bannu Khyber Pakhtunkhwa Pakistan. A total of 180 stool samples were collected from children under the age of 5 years from two major hospitals of Bannu from January to December (2015). The samples were analyzed by Reverse-transcriptase Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) for the detection of Rotavirus, positive samples were further processed for genotyping (G and P type) through specific PCR. Of the total, 41 (23%) samples were positive for Rotavirus. The most prevalent G genotypes found were: G3, G8, G9 (each 29%), followed by G10 (15%), and G11 (10%). Whereas the prevalent P genotypes were: P-8 (25%), P-4 and P-10 (each 20%), P-9 (15%), followed by P-6 and P-11 (each 10%). Moreover, Rotavirus infection was more prevalent in summer (23.73%) and winter (22.7%) than spring (20%) and autumn (21.4%). Rotavirus infection exhibited high frequency in June (14%), October (8%) and November (6%). It is concluded that Rotavirus is more prevalent in children and various genotypes (G and P) of Rotavirus are present in the study area. Lack of studies, awareness and rarer testing of Rotavirus are the principal reasons of virus prevalence in district Bannu, Pakistan.

Resumo A tuberculose é uma doença transmissível com altas taxas de morbimortalidade nos países em desenvolvimento. O objetivo principal do estudo é comparar métodos convencionais, como cultura de bacilo álcool-ácido resistente (BAAR) e microscopia, com métodos de diagnóstico rápido. O objetivo secundário é comparar os achados histopatológicos e microbiológicos em pacientes com suspeita de linfadenite tubercular. Um total de 111 amostras (agosto de 2018 a setembro de 2019) de gânglios linfáticos foi processado para microscopia de AFB, culturas de AFB, teste de susceptibilidade a drogas (DST), histopatologia e Xpert Mycobacterium tuberculosis (MTB)/ensaios de resistência à rifampicina (RIF). Das 111 amostras de linfonodos, 6 (5,4%) foram positivas para baciloscopia de AFB, 84 (75,6%) foram positivas para cultura de AFB, 80 (70,7%) foram positivas para o GeneXpert e 102 (91,8%) foram indicativas de tuberculose para estudos histopatológicos. A positividade da cultura do tubo indicador de crescimento de micobactérias (MGIT) foi 84 (75,6%), maior que a cultura sólida de Lowenstein-Jensen (LJ), 74 (66,6%). As culturas positivas foram submetidas a DST fenotípico. Dois casos eram multirresistentes (MDR) ao DST, enquanto três casos eram resistentes à rifampicina no GeneXpert. A sensibilidade do GeneXpert foi 62% contra o método convencional de cultura AFB. O fraco desempenho dos métodos convencionais de diagnóstico de linfadenite requer metodologia de diagnóstico precoce e precisa. O teste Xpert MTB/RIF pode ajudar no tratamento de casos de tuberculose multirresistente. No entanto, métodos rápidos e convencionais devem ser usados para o isolamento completo do Mycobacterium tuberculosis.

Abstract Tuberculosis is a communicable disease with high morbidity and mortality rates in developing countries. The study's primary objective is to compare conventional methods such as acid-fast bacillus (AFB) culture and microscopy with rapid diagnostic methods. The secondary objective is to compare histopathological and microbiological findings in suspected patients with tubercular lymphadenitis. A total of 111 samples (August 2018 to September 2019) of lymph nodes were processed for AFB microscopy, AFB cultures, drug-susceptibility testing (DST), histopathology, and Xpert Mycobacterium Tuberculosis (MTB)/resistance to Rifampin (RIF) assays. Out of 111 lymph node samples, 6 (5.4%) were positive for AFB smear microscopy, 84 (75.6%) were positive for AFB culture, 80 (70.7%) were positive on Gene Xpert, and 102 (91.8%) were indicative of tuberculosis for histopathology studies. Mycobacteria growth indicator tube (MGIT) culture positivity was 84 (75.6%) higher than solid Lowenstein-Jensen (LJ) culture 74 (66.6%). Positive cultures underwent phenotypic DST. Two cases were Multidrug-resistant (MDR) on DST, while three cases were Rifampicin resistant on Gene Xpert. The sensitivity of Genexpert was (62%) against the conventional AFB culture method. The poor performance of conventional lymphadenitis diagnostic methods requires early and accurate diagnostic methodology. Xpert MTB/RIF test can help in the treatment of multidrug-resistant TB cases. Nonetheless, rapid and conventional methods should be used for complete isolation of Mycobacterium tuberculosis.

Resumo A trepadeira Rufous (Dendrocitta vagabunda) pertence à família corvidae, ordem Passeriformes que inclui cerca de 100 espécies. O estudo atual foi realizado para reunir informações sobre a distribuição da população e análise do habitat de D. vagabunda no distrito de Abbottabad, Paquistão. Os dados foram coletados mensalmente pela manhã e à noite (2018-2019). O “método de contagem de pontos” foi usado para estimativa da população e o “método dos quadrados” para análise de habitat da área de estudo. O resultado mostra que uma densidade populacional média mensal de D. vagabunda foi máxima em Jhangra 0,14 ± 0,039 / ha, enquanto a mínima em Havelian 0,11 ± 0,022/ha. Não houve diferença significativa (p> 0,05) entre as densidades populacionais mensais de D. vagabunda, entretanto foi encontrada diferença significativa (p <0,05) entre os períodos matutino e noturno da população da espécie. O presente estudo revelou que o índice de valor de importância (IVI) das espécies de plantas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 59,6 ± 12,6, 50,1 ± 6,9, 53,4 ± 6,3, 66,8 ± 10 e 60,1 ± 7,7. Da mesma forma, a frequência de arbustos em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi de: 33,3 ± 4,2, 45 ± 9,4, 46,7 ± 8,2, 55,6 ± 22,2 e 37,5 ± 8,5. Da mesma forma, a frequência de ervas em Sherwan, Bakot, Havelian, Langra e Jhangra foi: 40,4 ± 6,0, 37,5 ± 5,6, 53,3 ± 7,4, 48,5 ± 5,2 e 46,9 ± 7,4, respectivamente. Nossos resultados mostram a área de estudo como habitat adequado para D. vagabunda.

Abstract The Rufous treepie (Dendrocitta vagabunda) belongs to family corvidae, order Passeriformes which includes about 100 species. The current study was conducted to gather information about the Population distribution and habitat analysis of D. vagabunda at District Abbottabad, Pakistan. The data were collected on monthly basis both morning and evening times (2018-2019). “The ‘’Point count Method” was used for population estimation and ‘’Quadrates Method” for habitat analysis of study area. The result shows an average month-wise population density of D. vagabunda was maximum at Jhangra 0.14±0.039/ha, whereas minimum at Havelian 0.11±0.022/ha. There was no significant difference (p>0.05) among monthly population densities of D. vagabunda, however, a significant difference (p<0.05) was found between morning and evening times population of the specie. The present study revealed that importance value index (IVI) of plants species at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 59.6±12.6, 50.1±6.9, 53.4±6.3, 66.8±10 and 60.1±7.7. Likewise, the frequency of shrubs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 33.3±4.2, 45±9.4, 46.7±8.2, 55.6±22.2 and 37.5±8.5. Similarly, the frequency of herbs at Sherwan, Bakot, Havelian, Langra and Jhangra were 40.4±6.0, 37.5±5.6, 53.3±7.4, 48.5±5.2 and 46.9±7.4 respectively. Our results show the study area as suitable habitat for D. vagabunda.

Abstract Toxoplasma gondii is an intracellular zoonotic protozoan parasite usually infects human and animal worldwide. This study aimed to analyze the sero-prevalence of T. gondii in blood of lactating animals and human living in close proximity and also to detect Toxoplasma DNA in unpasteurized milk of the studied animals. A total of 233 blood and milk samples were collected from lactating animals, and 735 blood samples were taken from humans in District Upper Dir, Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan. The blood samples were analyzed through ELISA while the milk samples were analyzed by PCR for the presence of T. gondii DNA. A standard questionnaire was introduced to collect the data from the participants. In animals, the reported sero-prevalence was 32.18% for IgM, 17.16% for IgG, and 6.4% for both IgM and IgG. The reported positivity for T. gondii DNA in milk was 14.44%, 34.8%, 20%, and 26% in sheep, goats, cows, and buffaloes, respectively. In the human blood samples, 9.8% were found positive for IgM and 11.2% for IgG while none of the samples was found positive for both IgM and IgG. Overall sero-prevalence reported in females was significantly higher than the male (p<0.05) poor hygiene condition (p < 0.0001) were the significant risk factors associated with T. gondii infections in animals. In conclusion, T. gondii infection is prevalent in lactating animals and humans using their raw milk in the study area. It is suggested that raw milk should be considered as a vehicle for the transmission of T. gondii to humans. Proper pasteurization of milk is very useful in limiting the transmission of infection. Awareness and control programs should be implemented to prevent the infection.

Resumo Toxoplasma gondii é um protozoário parasita intracelular zoonótico que geralmente infecta humanos e animais em todo o mundo. Este estudo teve como objetivo analisar a soroprevalência de T. gondii no sangue de animais lactantes e humanos que vivem em proximidade, além de detectar o DNA de Toxoplasma no leite não pasteurizado dos indivíduos estudados. Um total de 233 amostras de sangue e leite foram coletadas de animais lactantes e 735 amostras de sangue foram coletadas de humanos no Distrito Upper Dir Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão. As amostras de sangue foram analisadas pelo método ELISA enquanto as amostras de leite foram analisadas por PCR para a presença de DNA de T. gondii. Um questionário padrão foi introduzido para coletar os dados dos participantes. Em animais, a soroprevalência relatada foi de 32,18% para IgM, 17,16% para IgG e 6,4% para IgM e IgG. A positividade relatada para DNA de T. gondii encontrada no leite foi de 14,44%, 34,8%, 20% e 26% em ovelhas, cabras, vacas e búfalas, respectivamente. Nas amostras de sangue humano, 9,8% foram consideradas positivas para IgM e 11,2% para IgG, enquanto nenhuma das amostras foi considerada positiva para IgM e IgG. A soroprevalência geral relatada em mulheres foi significativamente maior do que em homens (p < 0,05). Neste estudo, contato com gatos (p < 0,0001), hábitos alimentares (p < 0,0001), fonte de água para beber (p < 0,0001) e más condições de higiene (p < 0,0001) foram os fatores de risco significativos associados a infecções por T. gondii em animais. Em conclusão, a infecção por T. gondii é prevalecente em animais lactantes e humanos que utilizam leite cru, isto é, não-pasteurizado, na área de estudo. Sugere-se que o leite não-pasteurizado seja considerado um veículo de transmissão do T. gondii para humanos. A pasteurização adequada do leite é muito útil para limitar a transmissão de infecções. Programas de conscientização e controle devem ser implementados para prevenir a infecção.